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R语言tidyr包的使用
tidyr包的作者是Hadley Wickham。这个包常跟dplyr结合使用。 本文将演示tidyr包中下述四个函数的用法: gather—宽数据转为长数据。类似于reshape2包中的melt函数 spread—长数据转为宽数据。
install.packages():安装第三方包。 library(package):加载第三方包。 useNamespace(library):使用指定的命名空间中的函数和变量。 import():导入指定的包并使用其中的函数和变量。
在R包中,最常用的包有下面四个:ggplotdplyr、readr、tidyr。ggplot2用于数据可视化,dplyr用于数据整理,readr用于将电子表格数据导入R,tidyr用于转置数据。而这四个R包,可以通过tidyvers包一并加载出来。
使用R的read.table读取相关数据:读取结果如下:基因表达信息 基因长度注释信息 样品分组信息 由基因的表达信息表格我们可以看到,该表格不符合tidy data的原则,需要使用Tidyr包对数据格式进行调整。
使用tidyr包的replace_na()函数。使用tidyr包的fill()函数将上/下一行的数值填充至选定列中NA。
r语言ggbio包使用方法
1、自上个版本后,Bioconductor 改进了安装方式,使用BiocManager包进行安装。再也不用记Bioconductor 的网址了。。每次更新R版本后,记得运行 检测Bioconductor 包的更新。
2、R语言+扩展包+RStudio安装方法:选择安装包最好去R语言官网,以搜索就能看到。CRAN里面有各种安装镜像,选择中国的产品,厦门大学版本。
3、首先在RGui标签项“帮助”里面有8个文档,可以直接打开,不过是英文的,下面提到的R文档都是英文的哈哈,呵呵!输入help.start(),点击回车键,打开网页获取帮助 如果没有反应,就把给出的网址复制下来在浏览器中打开。
4、vcfR 可以直接读取vcf格式的数据。如果同时读取参照序列fasta格式的序列文件和gff格式文件的注释文件还可以获取更完整的信息(此步骤并非必须,可以只读取vcf数据)。在此处便于重复用到了 pinfsc50 包。
5、这里简单介绍一种在Windows环境下对R软件自动升级的方法。
R语言数据对象与运算
在R语言中,有以下几种不同的数据对象:向量(vector):向量是一组数值或字符类型的元素的集合。向量中的所有元素必须是相同的类型。
在R中尽量使用-进行赋值,-更标准。在R中使用=进行赋值可能会出现错误(有些函数会将其解释为判断)——因为R起源于S语言,S语言的定义如此。
merge():合并两个数据框。merge(x,y,by = ID)。3str():显示一个对象的内部结构。str(Mydata)。3factor():定义变量作为因子。factor(x)。
在R中尽量使用 - 进行赋值, - 更标准。在R中使用 = 进行赋值可能会出现错误(有些函数会将其解释为判断)——因为R起源于S语言,S语言的定义如此。
R语言基础汇总
1、每一种分布有四个函数: d―density(密度函数),p―分布函数,q―分位数函数,r―随机数函数。 比如,正态分布的这四个函数为dnorm,pnorm,qnorm,rnorm。
2、FUN = mean).tapply函数根据第二个变量(Transect)的不同水平对第一变量(R)进行了求平均值运算。还可以求sd,var,length等操作。R语言初学者指南P75详细介绍了这个函数。
3、向量是 R 语言中最基本的数据类型,在 R 中没有单独的标量(例如 1 本质上是 c(1)) 。R 中可以用 = 或者 - 来进行赋值 , -的快捷键是 alt + - 。
4、开始一个新的R语言数据分析新项目,管理脚本、图片、文件的推荐方式:打开Rstudio,新建Rproject,新建脚本(脚本存放在生成的Rproject文件夹中)。
R语言prophet模型:下面是报错信息,请问一下这是什么原因造成的,最好给...
1、R语言prophet模型报错可能有以下几个原因:数据格式问题:prophet模型要求输入的数据格式必须符合一定的要求,例如时间序列必须是连续的等等。如果数据格式不符合要求,就会报错。
2、建行网页原因或点击人数过多。可以过一会儿在登录,或者换一种支付方式。
3、清洗化油器,检查化油器是否堵塞或质量性能太差,以及还是有调试不当等情况。检查汽油油质是否不好,油箱开关、汽油过滤器和油管等是否有问题造成供油不畅。
4、汽车正常跑着突然顿一下的原因是:供油系统出现问题,喷油嘴和节气门过脏,节气门积碳过多,造成供气不足;火花塞老化,需要更换火花塞;空气及油品质不好,这种现象主要发生在年久的车辆或不去做定期保养的车辆。
5、确认电源 a. 确认电源线的连接,插座是否如下图所示插好。如果延长线上有主电源开关,请确保它是开着的状态。
6、狗狗屁股附近破了,可能有多种原因。一种可能是皮肤感染,比如瘤背疮、湿疹或者真菌感染等。这些问题会导致狗狗皮肤发炎,甚至可能肿胀或者出疮。另外一种可能是外伤或者划伤。
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