r语言查看列表（r语言查看数据框行数和列数）
摘要：
1、R语言-数据类型及查看方式 2、R语言基础汇总 3、R语言prop.table() 4、r语言如何读取otu丰度表 查看数据类型：mode()， class(... 本篇目录：
R语言-数据类型及查看方式
查看数据类型：mode()， class()， typeof()， storage.mode() 逻辑值转换成数值时，TRUE转换成1，FALSE转换成0。
在R中尽量使用 - 进行赋值， - 更标准。在R中使用 = 进行赋值可能会出现错误（有些函数会将其解释为判断）——因为R起源于S语言，S语言的定义如此。
在R中，常见的数据类型一共有5种： 字符型character， 数值型numeric， 整形integer， 复数型complex， 逻辑型logical 还需要注意的是，如果我们直接输入1，2，3，..得到的是numeric类型。
向量是 R 语言中最基本的数据类型，在 R 中没有单独的标量（例如 1 本质上是 c(1)） 。R 中可以用 = 或者 - 来进行赋值 ， -的快捷键是 alt + - 。
mode() ：查看数据元素类型。1typeof() ：查看数据元素类型，基本等同于mode（），比mode()更为详细。1example()：假设有一个函数foo，example(foo)，函数foo的使用示例。
在R语言中，有以下几种不同的数据对象：向量（vector）：向量是一组数值或字符类型的元素的集合。向量中的所有元素必须是相同的类型。
R语言基础汇总
1、每一种分布有四个函数： d―density(密度函数)，p―分布函数，q―分位数函数，r―随机数函数。 比如，正态分布的这四个函数为dnorm，pnorm，qnorm，rnorm。
2、FUN = mean).tapply函数根据第二个变量(Transect)的不同水平对第一变量(R)进行了求平均值运算。还可以求sd，var，length等操作。R语言初学者指南P75详细介绍了这个函数。
3、向量是 R 语言中最基本的数据类型，在 R 中没有单独的标量（例如 1 本质上是 c(1)） 。R 中可以用 = 或者 - 来进行赋值 ， -的快捷键是 alt + - 。
4、开始一个新的R语言数据分析新项目，管理脚本、图片、文件的推荐方式：打开Rstudio，新建Rproject，新建脚本（脚本存放在生成的Rproject文件夹中）。
5、生命科学相关专业入门r语言的参考资料推荐如下：数据分析需要学四部分，即数学知识、分析工具、分析思维、开发工具及环境。数学知识：数学知识是数据分析师的基础知识。
R语言prop.table()
r里可以参考以下方法对列联表数据分析：卡方检验（Chi-squaretest）：使用chisq.test()函数进行卡方检验，以评估两个分类变量之间是否存在显著关联。
prop.table 可以计算年龄组的proportion；确保proportion 总和为只需将每个年龄组的原始 case 乘以该年龄组的 proportion 即可。
r语言为什么频率大于一？回答是：r语言为什么频率大于一？因为纵轴是概率密度(density)而不是频率(frequency)啊. 类比质量和密度的话，物体上一个点的密度数值大小是可以大于1的。
expect_Heat-as.data.frame(round(prop.table(table(expect$code_new10，expect$code_new12))，5)*100) colnames(expect_Heat)-c(from，to，value) #expect_Heat(表4)就是我们生成的用ggplot2来画热力图的数据集。
r语言如何读取otu丰度表
1、read.xlsx(filename，sheet=1，head=T)如果第一行是data，则head=T将强制第一列成为变量名，而head=F则需要一个XLSX包。
2、读取数据 一共有11个样本，每一个样本的测序reads都经过Nanopore官方的Epi2Me程序鉴定了物种，下表中第一列是被鉴定的菌种，第二列是该样本中每个物种产生的reads数目。
3、下面我使用R脚本，vegan包对ASV/OTU丰度矩阵中每个样本所对应的SAV/OTU总数绘制specaccum物种累计曲线。调用vegan包，读取物种数据；使用 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线；作图展示。
4、有个函数 fread() ，来自 data.table 包，可以更快地读取表格文件，速度可以快 近十倍 。
5、具体做法，首先每个样本中的OTU按丰度大小降序排列。然后以横坐标为各OTU的排列顺序，纵坐标为各OTU的丰度（最好使用相对丰度，并做对数转化）绘制图形。
到此，以上就是小编对于r语言查看数据框行数和列数的问题就介绍到这了，希望介绍的几点解答对大家有用，有任何问题和不懂的，欢迎各位老师在评论区讨论，给我留言。
