r语言改列名（r语言如何给列命名）

摘要： 本篇目录：1、r语言表达矩阵的列名与临床数据框的行名如何匹配2、...

本篇目录：

• 1、r语言表达矩阵的列名与临床数据框的行名如何匹配
• 2、R语言之基础
• 3、如何使用R语言将一个数据框的行名利用另一个数据替换?
• 4、R语言初学笔记:差异表达基因
• 5、R语言创建向量、数据框以及数据框的操作

r语言表达矩阵的列名与临床数据框的行名如何匹配

如果第一行是data，则head=T将强制第一列成为变量名，而head=F则需要一个XLSX包。

在 [，] 里，行在前面（左边），列在后面（右边），行与列用逗号 ， 隔开： [行，列]中括号里的逗号，表示维度的分割 数据框按照逻辑值取子集，TRUE对应的行/列留下，FALSE对应的行/列去掉。

read.xlsx(filename，sheet=1，head=T)如果你的第一行是数据，head=T会让第一列数据就会被强制为变量名，head=F则相反，这个需要xlsx包。

R语言Data Frame数据框常用操作：Data Frame一般被翻译为数据框，感觉就像是R中的表，由行和列组成，与Matrix不同的是，每个列可以是不同的数据类型，而Matrix是必须相同的。

方法1：数据框名称 [第几行，第几列]；方法2：数据框名称[第几行对应的名称，第几列对应的名称]，此方法相应的行名和列名一定要加双引号，否者运行是错误的。

R语言之基础

1、FUN = mean).tapply函数根据第二个变量(Transect)的不同水平对第一变量(R)进行了求平均值运算。还可以求sd，var，length等操作。R语言初学者指南P75详细介绍了这个函数。

2、向量是 R 语言中最基本的数据类型，在 R 中没有单独的标量（例如 1 本质上是 c(1)） 。R 中可以用 = 或者 - 来进行赋值 ， -的快捷键是 alt + - 。

3、名义型变量是没有顺序之分的类别变量。类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。因子在R中非常重要，因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。

4、例如上图，每个小方格表示每个基因，其颜色表示该基因表达量大小，表达量越大颜色越深（红色为上调，蓝色为下调）。每行表示每个基因在不同样本中的表达量情况，每列表示每个样品中所有基因的表达量情况。

5、从 R 0 开始，该参数默认为否，而且反斜杠是唯一被解释为逃逸引用符的字符（在前面描述的环境中）。

6、由“R开发核心团队”负责开发。R可以看作贝尔实验室（AT&T BellLaboratories）的Rick Becker、John Chambers和Allan Wilks开发的S语言的一种实现。当然，S语言也是S-Plus的基础。

如何使用R语言将一个数据框的行名利用另一个数据替换?

如果不指定行名，那么就是从1开始自增的Sequence来标识每一行。初始化使用data.frame函数就可以初始化一个Data Frame。

R语言t数据转置中一个简单的小问题，不注意就会犯错。

首先读入这个表格，有相应的函数，在R中就是一个数据框结构，类似矩阵。

在R语言中，空白数据可以通过一些函数进行替换，比如用`is.na()`函数来判断数据是否为空白，再利用`ifelse()`函数进行替换。

R语言初学笔记:差异表达基因

1、经过表达定量后，我们已经得到了基因的表达量矩阵，差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。差异基因表达分析通常都是在R中，常用的有DESeq2，edgeR，limma等几种，这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。

2、火山图可反映总体基因的表达情况，横坐标代表log2（Fold Change），纵坐标表示-log10（P值），每个点代表一个基因，颜色用以区分基因是否差异表达，图中橙色的点代表差异表达基因，蓝色的点代表没有差异表达的基因。

3、接下来通过该示例文件，展示使用R语言绘制差异基因表达“对称散点图”过程。首先对数据做一些预处理。

4、本节我们来学习如何在R语言中绘制这种特殊的Venn图。示例数据“treat1_control.txt”、“treat2_control.txt”和“treat3_control.txt”分别为3种不同试验处理下的样品，与对照组相比后识别的显著差异表达基因。

5、embed函数 R语言 多组样本的N种组合 对于单个基因在多个样本组中的差异表达，通常使用方差分析，即，将多个组比较在一起以获得P值。如果p值显著，说明多组基因表达有显著差异。

R语言创建向量、数据框以及数据框的操作

数据框（data frame）：数据框是具有相同长度的列的列表。数据框类似于电子表格或数据库表。

特点：相同类型，序列 如何创建向量？ 创建初始向量：vector（‘数据类型’，数据个数），例如，我们输入：x-vector(numeric，10)，可以得到如下结果，可以看到x的类型为数值型numeric。

向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。向量只可以包含一种数据。在R中创建和操作向量很简便，下面的例子显示了如何用函数c() 或者冒号运算符来建立向量以及如何查询、修改、截取一部分向量。

先构建向量，再组成数据框。直接用data.frame函数构建数据框。R语言的下标索引是从1开始的，且下标索引为负数的话表示删除某个元素。 [] 可进行索引，括号内对应的是[行下标， 列下标]。

到此，以上就是小编对于r语言如何给列命名的问题就介绍到这了，希望介绍的几点解答对大家有用，有任何问题和不懂的，欢迎各位老师在评论区讨论，给我留言。