k-meansr语言(kmeans方法)
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r语言k-means结果怎么看
1、从样本点中随机选择k个点作为初始簇中心就可以查看kmeans聚类分析结果。用各簇中所有样本的中心点代替原有的中心点,就可以依据kmeans聚类分析结果看哪些样本在哪组了。
2、K-means算法确定了每个聚类的中心点,可以获取这些中心点的坐标,代表了每个聚类的平均值,通过观察这些中心点的数值,可以对每个聚类的范围有一定的了解。
3、K-means算法是很典型的基于距离的聚类算法,采用距离作为相似性的评价指标,即认为两个对象的距离越近,其相似度就越大。该算法认为簇是由距离靠近的对象组成的,因此把得到紧凑且独立的簇作为最终目标。
4、两种方法对比:在K-means聚类中,是预先规定出要产生多少个类别的数量,再根据类别数量自动聚成相应的类。
R语言常用函数(基本)
就是R语言类率分布函数的开头字母。 比如说,正态分布是norm的化,那密度函数就是dnorm(),分布函数就是pnorm(), 更有用的是用相应分布生成随机数,比如rnorm(),就会生成服从正态分布的随机数。
R语言中的数学函数除了三角函数之外,还有相应的指数函数和对数函数,常见的指数函数有exp,对数函数有log、log10。
R语言中,和排序相关的常用函数有: order() , sort() , rank() ,一般是对向量进行操作,也可以对数据框的列进行操作。
r语言中bpinom函数的基本用法为:pbinom(x,size,prob),该函数为事件的累积概率,它用于表示概率的单个值。例如:抛掷硬币100次,正面向上不超过50次的概率,即pbinom(50,100,0.5)。
)text 字符串类型。当未提供file参数时,则函数可以通过一个文本链接从text中读取数据。 (25)skipNul 逻辑值。是否忽略空值。默认为FALSE。
R语言学习笔记之聚类分析
下面的R代码生成Silhouette plot和分层聚类散点图。
下面我们用iris数据集来进行聚类分析,在R语言中所用到的函数为hclust。首先提取iris数据中的4个数值变量,然后计算其欧氏距离矩阵。
R语言中hclust函数的默认方法为最长距离法(complete-linkage)。以上的聚类过程即称之为 层级聚类 。
聚网络药理学中聚类分析分为两类,一是对分类处理,叫Q型,另一种是对变量处理,叫R型,R语言拥有的是大量和聚类分析相关的函数。聚类分析是把研究对象(样本或变量)分组成为由类似的对象组成多个类的一种统计方法。
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