r语言scheffe（R语言回归分析）
摘要：
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代谢组差异代谢物分析简介
1、代谢物 ：所有分子量小于1500Da的小分子物质，包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇、生物碱、小分子药物等等。代谢组 ：一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。
2、代谢组学是从整体上研究复杂生命现象的新兴学科。研究代谢组学的关键是要发展大规模、并行化测定复杂混合体系中代谢物组成信息和对大量数据进行分析和建模的能力。技术手段的发展是代谢组学发展的关键因素。
3、这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。
4、代谢组学(metabonomics/metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。
5、植物生理和分子生物学研究：代谢组学可以揭示植物的生理状态和基因表达模式，从而帮助理解植物的生长、发育和响应环境压力的机制。
6、代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。
生物统计题:用LSD法、SSR法、和q法对数据进行多重比较
1、显著水平主要有5%和1%两个水平，就是数据要小于0.05和0.01才达到显著，否则为不显著。查看你的数据只有1和2显著水平小于0.05，因此结果是：1-aA，4-abA，5-abA，3-abA，2-bA.。
2、多重比较法是指多个等方差正态总体均值的比较方法。经过方差分析法可以说明各总体均值间的差异是否显著，即只能说明均值不全相等，但不能具体说明哪几个均值之间有显著差异。
3、没有q法。SSR（新复极差法）LSR（最小显著极差法）方差分析结束后，固定模型下需要对存在显著差异的几组处理进行多重比较，常用的方法有最小显著差数法（LSD）和最小显著极差法（LSR）。
4、各处理间差异都显著。在处理1的时候，把它们分别标成a、b、c就可以了。如果一个子集中包含了两个或以上的处理，就标成一样的字母。如果一个处理包含在两个子集中，就将两个子集的字母都标注。
5、多重比较有多种方法，主要三种：最小显著差数法（LSD）、复极差法（q）和Duncan氏新复极差法(SSR)。最小显著差数法 (least significant difference)简称 LSD法，实质上是t测验。
统计方法的选择(4)--事后检验
参数事后检验还有其他方法，比如SNK法（Student-Newman-Keuls)事后检验，Duncan事后检验，Scheffe事后比较，这几个方法的检验都在agricolae包中，展现形式不外乎以上两种方式。
这个统计分析过程也被称作事后多重比较。关于多重比较的方法有多种：如SCheffe检验法、NewmAn -Keuls检验法、DunCAn的多距检验法、Tukey的可靠显著差异法( HSD)、费舍的最小显著差异法( LSD)等方法。
是。根据查询云生信学生物信息学可知，事后检验是在进行anova方差分析的时候，单因素方差分析，对组间进行一对一对的比较。单因素检验是一种常用的统计方法，用于比较三个或以上组之间的差异性。
在spss主页中输入数据，直接通过分析窗口选择非参数检验那里的相关样本。这个时候跳出新的界面，需要根据实际情况来设置。下一步等完成上述操作以后，就点击确定。
到此，以上就是小编对于R语言回归分析的问题就介绍到这了，希望介绍的几点解答对大家有用，有任何问题和不懂的，欢迎各位老师在评论区讨论，给我留言。
