r语言绘图教程（r语言绘制图）
摘要：
本篇目录：1、R语言绘制配对样品箱线图2、... 本篇目录：
- 1、R语言绘制配对样品箱线图
- 2、R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制
- 3、R语言可视化及作图8--坐标轴自定义和坐标系转换
- 4、R语言可视化及作图10--ggplot2的theme函数
- 5、“对称散点图”的绘制(R语言)
- 6、R语言|绘制金字塔图
R语言绘制配对样品箱线图
绘制箱线图表示两组基因的整体表达水平，并以散点表示样本，配对样本间以连线连接。这样，配对箱线图就获得了。箱线图描述了组间基因表达水平改变的趋势，在该图中可以看到MAP2基因的表达在肿瘤组织和正常组织中是不一致的。
小提琴图是箱线图与核密度图的结合。你可以使用vioplot包中的vioplot()函数绘制它。 Vioplot(x1，x2，...，names=，col=) x1， x2， ...：表示要绘制的一个或多个数值向量(将为每个向量绘制一幅小提琴图)。
na.action 参数是对NA值的操作，默认为忽略。ann 参数为逻辑值，是否绘制坐标轴。range 是一个延伸倍数，决定了箱线图的须延伸到什么位置。width 设置箱子的宽度。
箱线图（Boxplot）也称箱须图（Box-whisker Plot），是利用数据中的五个统计量：最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法。
read.table或者read.csv函数，读取TXT文件，绘制箱线图的命令是boxplot。
R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制
1、R 有几种用于制作图形的系统，但 ggplot2 是最优雅和最通用的系统之一。与大多数其他图形包不同，ggplot2 具有基于图形语法的底层语法，它允许您通过组合独立组件来组合图形。
2、ggplot2 是由 Hadley Wickham 创建的一个十分强大的可视化R包。按照 ggplot2 的绘图理念，Plot(图)= data(数据集)+ Aesthetics(美学映射)+ Geometry(几何对象)：在 ggplot2 中有两个主要绘图函数：qplot()以及ggplot()。
3、R语言 高阶可视化绘图系统：ggplot2入门 ggplot2是《The Grammar of Graphics》/《图形的语法》中提出了一套图形语法，将图形元素抽象成可以自由组合的要素，类似Photoshop中的图层累加，ggplot2将指定的元素/映射关系逐层叠加，最终形成所图形。
R语言可视化及作图8--坐标轴自定义和坐标系转换
首先，打开arctoolbox数据管理工具。然后，找到投影和变换，选择创建自定义坐标变换。点进去后，在窗口中输入相应的参数，如下图所示，有对应的七参数，和转换坐标系。
R语言作图时，默认情况下软件会按照自己的方式对坐标轴的项目进行排序，然而这种排序往往不是我们所希望的，因此需要想办法让坐标轴的项目按照我们希望的顺序输出。
tick.ratio表示次要刻度线相对于主刻度线的大小比例。
ggplot2默认是直角坐标系。- coord_cartesian()常用的其它坐标系：以mpg数据集为例，坐标轴翻转。
在R语言底层作图中，对坐标轴的调整主要通过调整plot函数、axis函数和title函数的一系列参数完成。
R语言可视化及作图10--ggplot2的theme函数
1、theme函数主要的用途是调节图的主题。如下图，主题主要分为整幅图 plot ，坐标轴 axis ，图例 legend ，面板 panel 和分面元素 facet 。其中经常用到的是坐标轴主题的修改，比如常见的坐标轴字体大小的修改。
2、theme 控制更精细的显示点，如字体大小和背景颜色。
3、ggplot2是R语言第三方可视化扩展包，在某种程度上它基本代替了R可视化。该包是RStudio首席科学家Hadley Wickham读博期间的作品，它强大的画图逻辑使得它称为R最流行的包之一。更多知识分享请到 https：//zouhua.top/ 。
“对称散点图”的绘制(R语言)
1、提到散点图，常见的还有另一种展示差异表达基因的样式：横纵坐标轴可分别代表两组基因表达均值，这种风格可以更方便直观对比基因在两组中的差异状态。
2、打开Excel表格，选中需要制作散点图的数据单元格，点击“插入”菜单下的“推荐的图表”。点击“所有图表”，选中“XY散点图”，然后界面右侧会显示很多的散点图，选择一个自己喜欢的，点击确定。
3、作为一种语言进行统计分析，R有一个随机数生成各种统计分布功能的综合性图书馆。R语言可以针对不同的分布，生成该分布下的随机数。其中有许多常用的个分布可以直接调用。
R语言|绘制金字塔图
1、选择合适的图形工具：首先，选择一款适合的图形设计工具，如Adobe Illustrator、Sketch或在线工具如Canva等。绘制正方形：在画布上绘制一个正方形，这将作为金字塔的底部。
2、步骤一：两个三角体的塔，一高一矮。步骤二：加上低矮的植物。步骤三：加上沙土的点，加上云彩和太阳。步骤四：最后给金字塔加上颜色。
3、首先，需要在纸张的中央绘制一个三角形，作为金字塔的底部。接着，从三角形的顶部向上绘制两条直线，使其交于一点，形成金字塔的顶部。然后，从三角形底部向上，根据需要绘制出金字塔的不同层次。
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