本文作者:叶叶

如何用r语言做热图(r语言热图教程)

叶叶 2024-11-22 21:42:29 80
如何用r语言做热图(r语言热图教程)摘要: 热图:用颜色变化直观的表达数据之间差异的图,是对实验数据进行质制和差异数据的展现,是数据挖掘类文章的标配,内容包括如何利用ggplot2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标...

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如何用R语言绘制热图

相关性分析其实较为简单,用R语言自带的cor()函数非常容易计算得到两两变量间的相关系数。下面我们就来看下如何用R语言实现相关性计算并绘制带有显著性星标的相关性热图。

热图源自于展示数据的平面图像,较大的数字以小的深灰色、黑色方格呈现,而较小的数字则以较亮的方格标示。如Toussaint Loua在1873年就曾使用这样的手法来绘制对 巴黎 各区的社会学统计。

如何用r语言做热图(r语言热图教程)

关于R环境搭建可参考教程, 【R语言入门】R语言环境搭建 - 绘制热图 通过一些数学函数,将原始值进行映射。该方法包括log、指数、正切等。当变量是正偏态分布的时候,选用log对数。是否取对数可根据自己的需求。

首先打开r语言文档,输入标题。然后选中标题。接着点击工具菜单栏的开始。之后可以在段落这边找到找到居中的选项。随后点击标题就会居中。

初学者R语言:热图基础画法及个性化调整详解

热图(Heatmap):用颜色变化直观的表达数据之间差异的图,是对实验数据进行质制和差异数据的展现,是数据挖掘类文章的标配。

内容包括如何利用ggplot2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标轴和图例等。

如何用r语言做热图(r语言热图教程)

相关性热图

这个图有问号是因为数据缺失、不确定性。数据缺失:在相关性热图的实际研究中,由于各种原因如测量错误、实验失败、数据丢失等导致某些数据点无法收集,标记问号表示缺失的数据。

相关性分析其实较为简单,用R语言自带的cor()函数非常容易计算得到两两变量间的相关系数。下面我们就来看下如何用R语言实现相关性计算并绘制带有显著性星标的相关性热图。

将待计算的数据导入origin中,然后选中数据,在主界面的右侧,找到【CorrelationPlot】,双击。双击这个选项后,进行相关的设置。点击【Preview】,就可以预览绘制的相关性热力图。

相关性分析热图1到-1不同范围分别代表如下:值接近1时:代表正相关,越接近蓝色的区域,表示两个变量之间的正相关性越强。值接近-1时:代表负相关,越接近红色的区域,表示两个变量之间的负相关性越强。

如何用r语言做热图(r语言热图教程)

首先打开r语言文档,输入标题。然后选中标题。接着点击工具菜单栏的开始。之后可以在段落这边找到找到居中的选项。随后点击标题就会居中。

在16s与代谢组贯穿分析中,相关性热图是一个重要的分析手段,主要用于逐一呈现细菌物种与代谢物间的相关性高低,是筛选潜在关联的物种与代谢物的主要途径,对于下游的实验起到指导意义。

到此,以上就是小编对于r语言热图教程的问题就介绍到这了,希望介绍的几点解答对大家有用,有任何问题和不懂的,欢迎各位老师在评论区讨论,给我留言。

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